MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 67717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	TAAT	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016011	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016011	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016011	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016011	G	6	6	306	311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016011	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	347547511
7	NC_016011	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
8	NC_016011	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
9	NC_016011	TCAT	2	8	416	423	25 %	50 %	0 %	25 %	347547511
10	NC_016011	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
11	NC_016011	AAG	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
12	NC_016011	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
13	NC_016011	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
14	NC_016011	CT	3	6	751	756	0 %	50 %	0 %	50 %	347547511
15	NC_016011	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547511
16	NC_016011	ATGC	2	8	795	802	25 %	25 %	25 %	25 %	347547511
17	NC_016011	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547511
18	NC_016011	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
19	NC_016011	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
20	NC_016011	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
21	NC_016011	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
22	NC_016011	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
23	NC_016011	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
24	NC_016011	AACAAA	2	12	1030	1041	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347547511
25	NC_016011	TTA	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
26	NC_016011	CCA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547511
27	NC_016011	TAA	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547511
28	NC_016011	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
29	NC_016011	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547511
30	NC_016011	TAAA	2	8	1300	1307	75 %	25 %	0 %	0 %	347547511
31	NC_016011	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547511
32	NC_016011	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547511
33	NC_016011	ACGT	2	8	1417	1424	25 %	25 %	25 %	25 %	347547511
34	NC_016011	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547511
35	NC_016011	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
36	NC_016011	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	347547511
37	NC_016011	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547511
38	NC_016011	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547511
39	NC_016011	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
40	NC_016011	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547511
41	NC_016011	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	347547511
42	NC_016011	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016011	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016011	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016011	AT	4	8	1844	1851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016011	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
47	NC_016011	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
48	NC_016011	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
49	NC_016011	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547512
50	NC_016011	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547512
51	NC_016011	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
52	NC_016011	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547512
53	NC_016011	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	347547512
54	NC_016011	GCCTT	2	10	2415	2424	0 %	40 %	20 %	40 %	347547512
55	NC_016011	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
56	NC_016011	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	347547512
57	NC_016011	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
58	NC_016011	AAC	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
59	NC_016011	A	6	6	2572	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	347547512
60	NC_016011	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
61	NC_016011	GAAG	2	8	2603	2610	50 %	0 %	50 %	0 %	347547512
62	NC_016011	TTA	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
63	NC_016011	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547512
64	NC_016011	TCT	2	6	2774	2779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547512
65	NC_016011	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547512
66	NC_016011	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
67	NC_016011	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547512
68	NC_016011	CAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547512
69	NC_016011	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547512
70	NC_016011	T	8	8	3052	3059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016011	AGG	2	6	3102	3107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016011	ATG	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016011	CAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016011	TGAT	2	8	3214	3221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016011	TTG	2	6	3241	3246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016011	CAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016011	T	7	7	3290	3296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016011	ATT	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016011	TGA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016011	TGT	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016011	T	6	6	3415	3420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016011	ATT	2	6	3426	3431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016011	ACC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016011	TA	3	6	3556	3561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016011	GCA	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016011	T	7	7	3613	3619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016011	TCT	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016011	CTA	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016011	TGT	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016011	GCT	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016011	TTAT	2	8	3739	3746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016011	CTTC	2	8	3836	3843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016011	ATTT	2	8	3859	3866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016011	TAA	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016011	TTC	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016011	TGT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016011	GGC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016011	GCT	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016011	TCT	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016011	ATT	2	6	4079	4084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016011	T	6	6	4126	4131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016011	TTG	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016011	GTTA	2	8	4178	4185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016011	TGT	3	9	4210	4218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016011	TATTT	2	10	4222	4231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016011	TGG	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016011	CAA	2	6	4389	4394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016011	GAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016011	CGA	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016011	A	6	6	4471	4476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016011	ATTTT	2	10	4493	4502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016011	T	8	8	4499	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016011	AATA	2	8	4507	4514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016011	A	7	7	4537	4543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016011	AT	3	6	4556	4561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016011	TAT	2	6	4576	4581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016011	A	7	7	4615	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016011	TGAT	2	8	4697	4704	25 %	50 %	25 %	0 %	347547513
119	NC_016011	TGG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547513
120	NC_016011	CCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347547513
121	NC_016011	GA	3	6	4952	4957	50 %	0 %	50 %	0 %	347547514
122	NC_016011	TAT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547514
123	NC_016011	AGA	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
124	NC_016011	CA	3	6	5124	5129	50 %	0 %	0 %	50 %	347547514
125	NC_016011	AGA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
126	NC_016011	T	6	6	5262	5267	0 %	100 %	0 %	0 %	347547514
127	NC_016011	GCA	2	6	5334	5339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547514
128	NC_016011	CG	3	6	5507	5512	0 %	0 %	50 %	50 %	347547514
129	NC_016011	A	6	6	5597	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	347547514
130	NC_016011	AATC	2	8	5606	5613	50 %	25 %	0 %	25 %	347547514
131	NC_016011	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547514
132	NC_016011	GAT	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
133	NC_016011	ACA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
134	NC_016011	GAA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547514
135	NC_016011	GAT	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547514
136	NC_016011	ACTT	2	8	5846	5853	25 %	50 %	0 %	25 %	347547514
137	NC_016011	AAC	3	9	5886	5894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547514
138	NC_016011	ACT	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547514
139	NC_016011	A	7	7	5964	5970	100 %	0 %	0 %	0 %	347547514
140	NC_016011	TGA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016011	AAAG	2	8	6001	6008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016011	AAT	2	6	6017	6022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016011	AGA	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547515
144	NC_016011	AAGA	2	8	6114	6121	75 %	0 %	25 %	0 %	347547515
145	NC_016011	TTG	2	6	6182	6187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547515
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194	NC_016011	TTA	2	6	7993	7998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_016011	T	6	6	10637	10642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_016011	GTT	2	6	10752	10757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547517
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271	NC_016011	AC	4	8	11527	11534	50 %	0 %	0 %	50 %	347547517
272	NC_016011	TCTT	2	8	11574	11581	0 %	75 %	0 %	25 %	347547517
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